Niveau de dégradation des écosystèmes aquatiques au Bénin : Cas du cours d’eau du ranch faunique de Gbadagba situé dans l’arrondissement de Setto Commune de Djidja dans le département du Zou
Cette étude porte sur la caractérisation physicochimique, chimique et microbiologique du cours d’eau du ranch faunique de Gbadagba au Bénin, révélant une pollution chimique et microbiologique comme causes principales de la mort des poissons.
Université d’Abomey-Calavi (UAC)
École polytechnique d’Abomey-Calavi (EPAC)
Département de génie chimique-procédés (GC-P)
Option : Génie chimique (GC)
Mémoire de fin de formation pour l’obtention du diplôme d’ingénieur de conception grade master

Niveau de dégradation des écosystèmes aquatiques au Bénin : Cas du cours d’eau du ranch faunique de Gbadagba, situé dans l’arrondissement de Setto, Commune de Djidja dans le département du Zou
Dominique Kpadonou
Dirigé par: Mr. Avocanh Gautier & Dr. Gbaguidi A. N. Magloire
Année académique : 2021-2022
Dédicace
A mes parents, Mr Benoît KPADONOU et Mme Jeanne KPADONOU née DOSSOU pour les divers sacrifices et efforts consentis pour mon éducation. Veuillez recevoir ceci comme étant le début des fruits de vos efforts. Puisse l’Eternel vous faire en jouir encore plus. Amen !!!
Remerciements
A l’ETERNEL DIEU, le créateur des cieux et de la terre, lui qui m’a guidé tout au long de ce travail soient la gloire, l’honneur et louange d’éternité en éternité. Amen !
Par ailleurs, le présent travail n’aurait pas pu être réalisé sans la contribution, la disponibilité et la rigueur d’un grand nombre de personnes généreuses et aimables que je prie, sans distinction aucune de trouver mes expressions de gratitudes et de remerciements. Je ne peux remercier de façon exhaustive toutes les personnes physiques et morales qui m’ont apporté leurs soutiens d’une manière ou d’une autre, de peur d’en omettre mais toutefois, j’adresse mes sincères remerciements à ceux dont les noms suivent à titre d’exemple :
• Dr. Magloire A. N. GBAGUIDI, Maître de Conférences (MC) des Universités du CAMES et Enseignant-Chercheur à l’Ecole Polytechnique d’Abomey-Calavi (EPAC) et Chef de Département (CD) du département de Génie Chimique-Procédés (GC-P) à l’Ecole Polytechnique d’Abomey-Calavi (EPAC), pour avoir accepté malgré ses multiples occupations, d’encadrer ce travail et d’y consentir tous ses efforts. Que Dieu le bénisse et lui accorde la longévité pour l’accomplissement de toute sa mission divine sur terre. Amen !
• M. Gautier AVOCANH, Responsable du Laboratoire de la Direction Générale de l’Eau (DGEau) Cotonou, pour m’avoir accepté dans le laboratoire lors du stage de fin de formation et faciliter nos travaux de recherche en équipe pluridisciplinaire. Malgré ses multiples occupations administratives, il trouvait du temps précieux de conseils et d’incitation au goût du travail bien fait. Que l’Eternel lui soit reconnaissant pour cet acte fort important dans ma formation !
• Dr. Ir. Paul C. DJOGBENOU, Colonel à la retraite et coordonnateur du projet PAGEFCOM2 de la Direction Générale des Eaux, Forêts et Chasse, pour non seulement m’avoir donné l’autorisation d’investigation dans la zone d’étude, à savoir le cours d’eau du ranch faunique de Gbadagba, mais également pour m’avoir fourni une assistance technique à travers l’accompagnement du service des eaux et forêts départemental.
• Au Maire de Djidja pour m’avoir donné également l’autorisation d’accès au ranch faunique de Gbadagba sous sa tutelle territoriale, mais également pour m’avoir promis l’assistance des élus locaux ;
• Capitaine Charles KPOKPOYA spécialiste faune du projet PAGEFCOM2 pour la collaboration, l’accompagnement sur le terrain avec un véhicule adapté 4×4 pick-up et
pour toutes les dispositions prises pour que notre arrivée sur le terrain soit une réussite. Que l’Eternel le rehausse où qu’il soit et ceci toute sa vie. Amen !
• Mr. DJOGBENOU S. Tasisiris Conducteur de Véhicule Administratif (CVA) dans le projet PAGEFCOM2 pour sa disponibilité, sa participation active aux travaux de terrain, son ouverture d’esprit et d’humilité. Que Dieu lui accorde de grandes promotions plus qu’il n’imagine ! Amen !
• M. Hervé AGBAYAHOUN, biochimiste de formation pour sa gentillesse, son dynamisme, son esprit critique, de partage et surtout sa franche collaboration et assistance tout au long des travaux de laboratoire. Que l’Eternel Dieu vous exauce et vous bénisse au-delà de vos attentes ! Amen !
• Mme. Chantal TCHIGOSSOU, hydrobiologiste de formation pour sa collaboration franche et les sincères relations entretenues lors de nos travaux de laboratoire. Que Dieu vous comble de ses bienfaits. Amen !
• M. Louis EMINANON, Enseignant des Sciences de la Vie et de la Terre (SVT) pour son suivi, ses conseils et soutiens. Que Dieu le bénisse. Amen !
• M. Arnaud GNANSOUSNOU, juriste en formation pour la solidarité. Que Dieu le garde. Amen !
• Les stagiaires du laboratoire de la DGEau : M. Abdul SANNY, M. Bienvenu OGOUDELE et M. Jacob HOSSOU pour les divers soutiens et aides tout au long de monq stage à la Direction Générale de l’Eau. Que le Créateur soit votre guide ! Amen !
• Les promotionnaires Hector ALONOMBA, Cossi F. Winoc AMADJIKPE, Espérance Brice TOGBE, Claudie Alix Don de Dieu Abossèdé OLISSAN, François Edmond TOKPLO, Larissa HOUETO, Judith Fifamè HOUNKANRIN, Antoine Elian WOTTO et Farlhananth A. SANNY pour leur sens de solidarité et d’esprit scientifique tout au long de notre cycle d’ingénieur ;
• Mes sœurs Alice, Florence, Françoise Chantal et Lucienne KPADONOU pour leur confiance et leurs prières. Que Dieu veille sur vous. Amen !
Hommages
A son Excellence Monsieur le Président du jury
C’est un honneur pour moi de vous avoir comme président de jury. Veuillez recevoir l’expression de mon profond respect.
Aux Honorables membres du jury
Grande est ma joie de savoir que vous avez accepté d’apprécier ce travail, fruit de mes efforts. Vos remarques, suggestions et critiques contribueront, chers honorables membres du jury, à l’amélioration du présent document du point de vue rédactionnel et scientifique.
Liste des abréviations
CIVIS : Communauté Intercommunale des Villes Solidaires CT : Coliformes Totaux
CTT : Coliformes thermotolérants
CVA : Conducteur de Véhicule Administratif
CVPC : Coopérative villageoise de producteurs de coton DBO : Demande Biochimique Oxygène
DCO : Demande Chimique en Oxygène DGEau : Direction Générale de l’Eau
E. Coli : Escherichia Coli MES : Matières En Suspension NT : Azote total
pH : Potentiel Hydrogène PT : Phosphore total
TDS : Solides Totaux dissous SF : Streptocoques fécaux
SIGES : Système d’Information pour la Gestion des Eaux Souterraines en Seine-Normandie
Listes des figures
Figure 1 : L’organigramme de la DGEau Cotonou 2022 21
Figure 2 : situation géographique de la DGEau à Cotonou 22
Figure 3 : la zone d’étude et d’échantillonnage 23
Figure 5 : Spectrophotomètre DR5000 de la DGEau 24
Figure 4 : Turbidimètre de paillasse 24
Figure 6 : La boite de Chromogenic Coliform agar 24
Figure 9 : Variation de la température en °C en fonction des sites d’échantillonnages 30
Figure 10 : Variation de l’oxygène dissous en mg/L en fonction des sites d’échantillonnage 31
Figure 11 : Variation du TDS (mg/L) en fonction des sites d’échantillonnage 32
Figure 12 : Variation du POR en fonction des sites d’échantillonnage 33
Figure 13 : Variation des MES (mg/L) en fonction des sites d’échantillonnage 33
Figure 14 : Variation de la couleur en fonction des sites d’échantillonnage 34
Figure 15 : Variation de la concentration du nitrite en fonction des sites d’échantillonnage 35
Figure 16 : Variation de la concentration du nitrate en fonction des sites d’échantillonnage 36
Figure 17 : Variation de la concentration en mg/L de l’ammonium en fonction des sites d’échantillonnage 37
Figure 18 : Variation de la concentration en NTK (mg/L) en fonction des sites d’échantillonnage
. 38
Figure 19 : Variation de la concentration de l’ion orthophosphate (mg/L) en fonction des sites d’échantillonnage 39
Figure 20 : Variation de la concentration (mg/L) en phosphore total en fonction des sites d’échantillonnage 40
Figure 21 : Variation de la Demande Chimique en Oxygène (DCO) en fonction des sites d’échantillonnage 41
Figure 22 : Variation de la Demande Biochimique en Oxygène (DBO) en fonction des sites d’échantillonnage 41
Figure 23 : Variation des Coliformes totaux en fonction des sites d’échantillonnage 43
Figure 24 : Variation des E. Coli en fonction des sites d’échantillonnage 44
Figure 25 : Variation des coliformes thermotolérants en fonction des sites d’échantillonnages 45
Figure 26 : Variation des streptocoques en fonction des sites d’échantillonnages 45
Liste des tableaux
Tableau II : Abaque DBO (DBOth = 80%DCO AFNOR NF EN 1899-2 :1998) 59
Tableau III : Les données issues de l’échantillonnage 59
Tableau IV : Paramètres chimiques déterminés 60
Tableau V : Paramètres physico-chimiques déterminés 60
Tableau VI : Paramètres microbiologiques déterminés 61
Listes des symboles et unités
Unités (Symboles)Significationsmg/LMilligramme par Litremg/L O2Concentration d’ Oxygène dissous en Milligramme par Litre°CDegré Celsius (unité de température)NTUNephelometric Turbidity Unit (NTU)µS/CmMicro Siemens (Unité de conductivité électrique)mVMilli Volt (Unité de potentiel électrique)UFC/100mlUnité Formant colonie dans 100mLDMSDegrés Minutes Secondes
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ANNEXES
Tableau II : Abaque DBO (DBOth = 80%DCO AFNOR NF EN 1899-2 :1998)
DBOth (mg/L)Volume (mL)Facteur0-4043210-8036520-20025050-400164100-80097200-200043.550
Tableau III : Les données issues de l’échantillonnage
PARAMETRESUNITESSite 1Site 2Site 3Site 4Site 5COORDONNEES GEOGRAPHIQUESXDMS001°58’40.6765 »E1°58’35.20956 »E1°58’33.1370″E1°58’30.4770″E1°58’29.4096″EY7°34’43.5936″N7°34’38.7030″N7°34’36.3364″N7°34’33.2310″N7°34’31.9850″NPARAMETRES PHYSICO-CHIMIQUESpH-6,215,836,175,826,88TDSmg/L128,7129,36129,35129,36129,35Temperature°C26,826,526,926,526,7Oxygène dissousmg/LO28,917,717,367,667,51ORPmV170,3159,5153,7153,5161,5Couleur101120124115136MESmg/L111210812DCOmg/L1536221723DBO5mg/L5,25,45,56,35,8PO43-mg/L0,120,2050,2150,160,14PTmg/L0,50,350,250,210,3NH4+mg/L0,180,20,180,150,15
NO2-mg/L1,31,181,3041,31,299NO3-mg/L2,5242,3182,0992,2632,221NTmg/L1,09651,291,48350,83850,5805PARAMETRES MICROBIOLOGIQUESCTUFC/100ml1760016500157001800017600E. ColiUFC/100ml1600016200150001770017400ColiformesThermotolerantsUFC/100ml200200300130500StreptocoquesUFC/100ml8005001300600600SalmonellesUFC/100ml10010010125250
Tableau IV : Paramètres chimiques déterminés
SitesPO 3-4(mg/L)PT(mg/L)NH +4(mg/L)NO -2(mg/L)NO -3(mg/L)NTK(mg/L)DCO(mg/L)DBO5(mg/L)Site 10,120,50,181,32,5241,0965155,2Site 20,2050,350,21,182,3181,29365,4Site 30,2150,250,181,3042,0991,4835225,5Site 40,160,210,151,32,2630,8385176,3Site 50,140,30,151,2992,2210,5805235,8moyen ne0,1680,3220,1721,27662,2851,057822,65,64Ecartype0,0410182890,112561090,021679480,054035170,156033650,357960478,203657720,42778499CV%24,4156479834,956861712,60435084,232741176,8286061433,840090136,29937047,5848403
Tableau V : Paramètres physico-chimiques déterminés
Site 1Site 2Site 3Site 4Site 5moyenneécartypepH6,215,836,175,826,886,1820,43101044Température (°C)26,826,526,926,526,726,680,17888544Oxygène dissous (mgO2/L)8,917,717,367,667,517,830,61907189TDS (mg/L)128,7129,36129,35129,36129,35129,2240,29296757ORP (mg/L)170,3159,5153,7153,5161,5159,76,89347518MES (mg/L)11121081210,61,67332005Couleur101120124115136119,212,7945301
Tableau VI : Paramètres microbiologiques déterminés
Germes (UFC/100mL)Site 1Site 2Site 3Site 4Site 5MoyenneCT176001650015700180001760017080E. Coli160001620015000177001740016460CTT200200300130500266Streptocoques8005001300600600760Salmonelles10010010125250117
Table des matières
Dédicace vi
Remerciements vii
Hommages ix
Liste des abréviations x
Listes des figures xi
Liste des tableaux xii
Listes des symboles et unités xii
Résumé xiii
Abstract xiv
Sommaire xv
Introduction 1
Hypotheses de recherche 3
Objectifs de recherche 4
• Synthese bibliographique 5Clarification conceptuelle 5Environnement 5Eau 5Eau de surface ou eau superficielle 6Eau usée industrielle 6Notion de polluant 7Pollution 8La pollution des eaux ou pollution aquatique 9Eutrophisation 9Paramètres physiques, physico-chimiques, chimiques et microbiologique de suivi de la pollution des eaux de surfaces 9Paramètres physiques de suivi de la qualité des eaux de surface 9Paramètres physico-chimiques de suivi de la qualité des eaux de surfaces 12Paramètres microbiologiques de suivi de la qualité des eaux de surface 15Etat de l’art des differentes formes de pollution des eaux de surface dans le monde, la sous-region et au benin 16Etat de la pollution physique des eaux de surface 17Etat de la pollution physico-chimique des eaux de surface 17Etat de la pollution chimique des eaux de surface 17Etat de la pollution microbiologique des eaux de surface 20
• Clarification conceptuelle 5Environnement 5Eau 5Eau de surface ou eau superficielle 6Eau usée industrielle 6Notion de polluant 7Pollution 8La pollution des eaux ou pollution aquatique 9Eutrophisation 9Paramètres physiques, physico-chimiques, chimiques et microbiologique de suivi de la pollution des eaux de surfaces 9Paramètres physiques de suivi de la qualité des eaux de surface 9Paramètres physico-chimiques de suivi de la qualité des eaux de surfaces 12Paramètres microbiologiques de suivi de la qualité des eaux de surface 15
• Environnement 5
• Eau 5
• Eau de surface ou eau superficielle 6
• Eau usée industrielle 6
• Notion de polluant 7
• Pollution 8
• La pollution des eaux ou pollution aquatique 9
• Eutrophisation 9
• Paramètres physiques, physico-chimiques, chimiques et microbiologique de suivi de la pollution des eaux de surfaces 9Paramètres physiques de suivi de la qualité des eaux de surface 9Paramètres physico-chimiques de suivi de la qualité des eaux de surfaces 12Paramètres microbiologiques de suivi de la qualité des eaux de surface 15
• Paramètres physiques de suivi de la qualité des eaux de surface 9
• Paramètres physico-chimiques de suivi de la qualité des eaux de surfaces 12
• Paramètres microbiologiques de suivi de la qualité des eaux de surface 15
• Etat de l’art des differentes formes de pollution des eaux de surface dans le monde, la sous-region et au benin 16Etat de la pollution physique des eaux de surface 17Etat de la pollution physico-chimique des eaux de surface 17Etat de la pollution chimique des eaux de surface 17Etat de la pollution microbiologique des eaux de surface 20
• Etat de la pollution physique des eaux de surface 17
• Etat de la pollution physico-chimique des eaux de surface 17
• Etat de la pollution chimique des eaux de surface 17
• Etat de la pollution microbiologique des eaux de surface 20
• Cadre d’etude, materiel et methodes 21Cadre d’etude 21Cadre du stage : direction générale de l’eau 21Cadre d’étude : le cours d’eau du ranch faunique de GBADAGBA 22Materiel 23Matériel du terrain 23Matériel de laboratoire utilisé 24Methodes 25La revue de littérature 25La campagne d’échantillonnage et de mesure in-situ 25Méthodes de prélèvement pour les analyses physico-chimiques 25Méthodes de prélèvement pour les analyses microbiologiques 25Méthodes d’analyses physico-chimiques au laboratoire 26Le dosage de l’ion ammonium est fait selon la norme NFT90-015-2 26Le dosage de l’ion nitrate par la méthode AFNOR (T90-012) 26Dosage de l’ion nitrites NO2- selon la méthode AFNOR (T90-013) 26Dosage de l’azote total (NT) selon la norme ISO 7150/1 26Dosage de l’ion orthophosphate et du phosphore total selon la norme NF EN ISO 6878 (T90-023) 26Le dosage de la couleu’absorption moléculaire 27Dosage des matières en suspension (MES) 27Détermination de la demande chimique en oxygène (DCO) selon la méthode normalisée AFNOR T90-101 27Demande biochimique en oxygène selon la norme AFNOR NF EN 1899-2 :1998 27Analyses microbiologiques 27
• Cadre d’etude 21Cadre du stage : direction générale de l’eau 21Cadre d’étude : le cours d’eau du ranch faunique de GBADAGBA 22
• Cadre du stage : direction générale de l’eau 21
• Cadre d’étude : le cours d’eau du ranch faunique de GBADAGBA 22
• Materiel 23Matériel du terrain 23Matériel de laboratoire utilisé 24
• Matériel du terrain 23
• Matériel de laboratoire utilisé 24
• Methodes 25La revue de littérature 25La campagne d’échantillonnage et de mesure in-situ 25Méthodes de prélèvement pour les analyses physico-chimiques 25Méthodes de prélèvement pour les analyses microbiologiques 25Méthodes d’analyses physico-chimiques au laboratoire 26Le dosage de l’ion ammonium est fait selon la norme NFT90-015-2 26Le dosage de l’ion nitrate par la méthode AFNOR (T90-012) 26Dosage de l’ion nitrites NO2- selon la méthode AFNOR (T90-013) 26Dosage de l’azote total (NT) selon la norme ISO 7150/1 26Dosage de l’ion orthophosphate et du phosphore total selon la norme NF EN ISO 6878 (T90-023) 26Le dosage de la couleu’absorption moléculaire 27Dosage des matières en suspension (MES) 27Détermination de la demande chimique en oxygène (DCO) selon la méthode normalisée AFNOR T90-101 27Demande biochimique en oxygène selon la norme AFNOR NF EN 1899-2 :1998 27Analyses microbiologiques 27
• La revue de littérature 25
• La campagne d’échantillonnage et de mesure in-situ 25Méthodes de prélèvement pour les analyses physico-chimiques 25Méthodes de prélèvement pour les analyses microbiologiques 25
• Méthodes de prélèvement pour les analyses physico-chimiques 25
• Méthodes de prélèvement pour les analyses microbiologiques 25
• Méthodes d’analyses physico-chimiques au laboratoire 26Le dosage de l’ion ammonium est fait selon la norme NFT90-015-2 26Le dosage de l’ion nitrate par la méthode AFNOR (T90-012) 26Dosage de l’ion nitrites NO2- selon la méthode AFNOR (T90-013) 26Dosage de l’azote total (NT) selon la norme ISO 7150/1 26Dosage de l’ion orthophosphate et du phosphore total selon la norme NF EN ISO 6878 (T90-023) 26Le dosage de la couleu’absorption moléculaire 27Dosage des matières en suspension (MES) 27Détermination de la demande chimique en oxygène (DCO) selon la méthode normalisée AFNOR T90-101 27Demande biochimique en oxygène selon la norme AFNOR NF EN 1899-2 :1998 27
• Le dosage de l’ion ammonium est fait selon la norme NFT90-015-2 26
• Le dosage de l’ion nitrate par la méthode AFNOR (T90-012) 26
• Dosage de l’ion nitrites NO2- selon la méthode AFNOR (T90-013) 26
• Dosage de l’azote total (NT) selon la norme ISO 7150/1 26
• Dosage de l’ion orthophosphate et du phosphore total selon la norme NF EN ISO 6878 (T90-023) 26
• Le dosage de la couleu’absorption moléculaire 27
• Dosage des matières en suspension (MES) 27
• Détermination de la demande chimique en oxygène (DCO) selon la méthode normalisée AFNOR T90-101 27
• Demande biochimique en oxygène selon la norme AFNOR NF EN 1899-2 :1998 27
• Analyses microbiologiques 27
• Resultats et discussion 29Presentation des resultats de mesures physico-chimiques et discussion 29Le pH 29La température 30L’oxygène dissous 31Les solides totaux dissous (TDS) 32Le potentiel d’oxydoréduction 33Les matières en suspension MES 33La couleur 34
• Presentation des resultats de mesures physico-chimiques et discussion 29Le pH 29La température 30L’oxygène dissous 31Les solides totaux dissous (TDS) 32Le potentiel d’oxydoréduction 33Les matières en suspension MES 33La couleur 34
• Le pH 29
• La température 30
• L’oxygène dissous 31
• Les solides totaux dissous (TDS) 32
• Le potentiel d’oxydoréduction 33
• Les matières en suspension MES 33
• La couleur 34
Conclusion partielle 1 34
• Presentation des resultats d’analyses chimiqueet discussion 35Ion nitrite NO2 35Ion nitrate NO3 36Ion ammonium 37Azote total kjeldahl (NTK) 38Ion orthophosphate (PO43-) 39Phosphore total PT 40Demande chimique en oxygène DCO 41Demande biochimique en oxygène en 5jours DBO5 41
• Presentation des resultats d’analyses chimiqueet discussion 35Ion nitrite NO2 35Ion nitrate NO3 36Ion ammonium 37Azote total kjeldahl (NTK) 38Ion orthophosphate (PO43-) 39Phosphore total PT 40Demande chimique en oxygène DCO 41Demande biochimique en oxygène en 5jours DBO5 41
• Ion nitrite NO2 35
• Ion nitrate NO3 36
• Ion ammonium 37
• Azote total kjeldahl (NTK) 38
• Ion orthophosphate (PO43-) 39
• Phosphore total PT 40
• Demande chimique en oxygène DCO 41
• Demande biochimique en oxygène en 5jours DBO5 41
Conclusion partielle 2 42
• Presentation des resultats d’analyse microbiologiqueet discussion 43Les coliformes totaux CT 43Escherichia coli (E. Coli) 44Les coliformes thermotolérants (CTT) 45Les streptocoques fécaux SF 45Les salmonelles 46
• Presentation des resultats d’analyse microbiologiqueet discussion 43Les coliformes totaux CT 43Escherichia coli (E. Coli) 44Les coliformes thermotolérants (CTT) 45Les streptocoques fécaux SF 45Les salmonelles 46
• Les coliformes totaux CT 43
• Escherichia coli (E. Coli) 44
• Les coliformes thermotolérants (CTT) 45
• Les streptocoques fécaux SF 45
• Les salmonelles 46
Conclusion partielle 3 46
Conclusion 47
Perspectives 49
Références bibliographiques 50
Annexes 59
Table des matières 62