L’analyse comparative des zones humides révèle des découvertes fascinantes sur les souches bactériennes et leur activité enzymatique dans les sites Ramsar d’Oran et de Bechar. Comment ces résultats peuvent-ils influencer la conservation et la gestion des écosystèmes aquatiques?
Caractérisation bactériennes :
Nous avons réussi à isoler et purifier 35 souches appartenant aux genres différents (voir tableau 30, 31,32).
Examen macroscopique :
L’isolement se fait à partir des colonies suspectes alors que l’examen macroscopique est réalisé à partir des colonies du second repiquage sur les différents milieux spécifiques aux bactéries recherchés.
Nous nous sommes intéressées uniquement aux colonies répondant aux caractéristiques décrites dans la partie synthèse bibliographique contenant les différents genres et espèces bactériennes aquatiques voir les tableaux 30, 31 ,32.
Examen microscopique :
L’observation microscopique des bacilles révèle la présence de cellules en formes de bâtonnets ou sorte de bâtonnets plus ou moins allongées (Cocco bacilles) de tailles variables, les cellules isolées en chainettes plus ou moins longues l’examen microscopique montre des cocci de forme sphérique parfois ovoïdes , de diamètres variable , la disposition des cellules et soit en amas ,en paires ,en chainettes voir les tableaux 30, 31 ,32.
Identification biochimique :
Les résultats de l’identification biochimique par utilisation des systèmes Api 20 E sont reportés dans le tableau 33 et les photos 12, 13, 14, concernant les souches d’Escherichia.Coli appartenant à la famille des Enterobactereaceae, ainsi les souches de Bacillus.cereus appartenant au Bacillaceae, les tableaux 30, 31 ,32 présentent le type oxydase et catalase.
Tableau 30: Caractérisation (identification) préliminaire des souches bactériennes isolées à partir de la zone humide Djorf torba.
| Code des souches | Aspect macroscopique | Aspect microscopique | Test biochimique | Genre suspecte | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| milieu | forme | couleur | gram | forme | regroupement | oxydase | catalase | ||
| A1 | GN | ronde | blanche | + | bacille | chaine | + | + | Bacillus.sp |
| A2 | King a | ronde | Bleu verte | – | bacille | seul | + | + | Pseudomonas.a |
| A3 | King b | ronde | Blanche fluorescent | – | bacille | seul | + | – | Pseudomonas.f |
| A4 | GNAB | ronde | Transparente blanche | – | bacille | Virgule seul | + | – | Vibrio.sp |
| A5 | TGEA | lentille | blanche | + | bacille | Chaine/seul | + | – | Clostriduim.sp |
| A6 | TGEA | ronde | jaune | + | coccidé | Amas de 4 | – | – | Streptococcus.sp |
| A7 | SS | ronde | Centre noir et contour blanc | – | bacille | seul | + | – | Selmonella.sp |
| A8 | SS | ronde | Rouge rose | – | bacille | seul | + | – | Citrobacter.sp |
| A9 | TTC | ronde | Jaune | – | bacille | Chaine/seul | + | + | Escherichia. coli |
| A10 | GN Chapman |
ronde | jaune | + | coccidé | Chaine et Tétrade | + | + | Micrococcus.sp |
| A11 | GN Chapman |
ronde | Jaune doré | + | coccidé | Grappe Et Tétrade | – | + | Staphylococcus. a |
| A12 | Gélose Mosel | ronde | rose | + | bacille | seul | – | + | Bacillus.cereus |
Tableau 31 : Caractérisation (identification) préliminaire des souches bactériennes isolées à partir de la zone humide Macta
| Code des souches | Aspect macroscopique | Aspect microscopique | Test biochimique | Genre suspecte | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| milieu | forme | couleur | gram | forme | regroupement | oxydase | catalase | ||
| M1 | GN/ Gélose Mosel |
ronde | blanche | + | bacille | chaine | + | + | Bacillus.sp |
| M2 | King a | ronde | Bleu verte | – | bacille | seul | + | + | Pseudomonas.a |
| M3 | King b | ronde | Blanche fluorescent | – | bacille | seul | + | – | Pseudomonas.f |
| M4 | GNAB | ronde | Transparente blanche | – | bacille | Virgule seul | + | – | Vibrio.sp |
| M5 | TGEA | lentille | blanche | + | bacille | Chaine/seul | + | – | Clostriduim.sp |
| M6 | TGEA/ M17 | ronde | jaune | + | coccidé | Amas de 4 | – | – | Streptococcus.sp |
| M7 | SS | ronde | Centre noir et contour blanc | – | bacille | seul | + | – | Selmonella.sp |
| M8 | SS | ronde | Rouge rose | – | bacille | seul | + | – | Citrobacter.sp |
| M9 | TTC | ronde | Jaune | – | bacille | Chaine/seul | + | + | Escherichia. coli |
| M10 | GN Chapman |
ronde | jaune | + | coccidé | Chaine et Tétrade | + | + | Micrococcus.sp |
| M11 | MRS | ronde | blanche | + | coccidé | seul | – | – | Leuconostoc. sp |
| M12 | Gélose Mosel | ronde | rose | + | bacille | seul | – | + | Bacillus.cereus |
Tableau 32 : Caractérisation (identification) préliminaire des souches bactériennes isolées à partir de la zone humide Télamine
| Code des souches | Aspect macroscopique | Aspect microscopique | Test biochimique | Genre suspecte | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| milieu | forme | couleur | gram | forme | regroupement | oxydase | catalase | ||
| T1 | MRS | ronde | blanche | + | bacille | Chaine et seul | – | – | Lactobacillus.sp |
| T2 | King a | ronde | Bleu verte | – | bacille | seul | + | + | Pseudomonas.a |
| T3 | King b | ronde | Blanche fluorescent | – | bacille | seul | + | – | Pseudomonas.f |
| T4 | GNAB | ronde | Transparente blanche | – | bacille | Virgule seul | + | – | Vibrio.sp |
| T5 | TGEA | lentille | blanche | – | bacille | Chaine/seul | + | – | Clostriduim.sp |
| T6 | TGEA | ronde | Jaune orangé | – | bacille | seul | + | + | Flavobacterium.sp |
| T7 | SS | ronde | Centre noir et contour blanc | – | bacille | seul | + | – | Salmonella.sp |
| T8 | SS | ronde | incolore | – | bacille | seul | + | – | Shiguella. sp |
| T9 | GVFS | ronde | noir | + | bacille | Chaine/seul | – | + | Clostriduim.perfringens |
| T10 | GN/TGEA | ronde | bleu | – | bacille | chaine | + | + | Aeromonas. hydrophilia |
| T11 | Chapman | ronde | jaune | + | coccidé | Chaine et Tétrade | + | + | Micrococcus.sp |
| T12 | Gélose Mosel | ronde | rose | + | bacille | seul | – | + | Bacillus.cereus |
1
2
Photo 05 : Aspect macroscopique(1) et microscopique(2) du genre Vibrio.sp
sur GNAB Grx100x10
[18_img_3]
[18_img_4]
[18_img_5]
1
2
Photo 06 : Aspect macroscopique(1) et microscopique(2) d’Escherichia. Coli sur
TTC Grx100x10
[18_img_6]
[18_img_7]
[18_img_8]
1
2
Photo 07 : Aspect macroscopique(1) et microscopique(2) du genre Salmonella.sp sur ss
Grx100x10
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[18_img_10]
[18_img_11]
1
2
Photo08 : Aspect macroscopique(1) et microscopique(2) du genre
Streptococcus.sp sur M17/ Grx100x10
[18_img_12]
[18_img_13]
1
2
Photo09 : Aspect macroscopique(1) et microscopique(2) de
Pseudomonas.fluorescent sur Kingb/ Grx100x10
[18_img_14]
1
2
Photo10 : Aspect macroscopique(1) et microscopique(2) du genre Bacillus.sp sur Mosel/ Grx100x10
1
2
Photo11 : Aspect macroscopique(1) et microscopique(2) du genre
Staphylococcus.aureus sur Chapman/ Grx100x10
Vu la nécessité de vérifier la pureté de certains souches appartenant à la famille des Enterobactereaceae et Bacillaceae on a exercé des testes supplémentaires par des galeries biochimiques de type Api20E (Référence BIOMERIEUX C07223).
Tableau 33: Le profil d’identification numérique de 5 bactéries aquatiques par system de galerie biochimique Api 20E
| Codes de souches | Genre de souches | Caractères biochimiques | ||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ONPG | ADH | LDC | ODC | CIT | H2S | URE | TDA | IND | VP | GEL | GLU | MAN | INO | SOR | RHA | SAC | MEL | AMY | ARA | |||
| API 20 E : | ||||||||||||||||||||||
| A12 | Bacillus.cereus | – | – | – | – | + | – | – | – | – | + | + | + | – | – | – | – | ? | ? | – | – | |
| M12 | Bacillus.cereus | – | – | – | – | + | – | – | – | – | + | + | + | – | – | – | – | ? | ? | – | – | |
| T12 | Bacillus.cereus | – | – | – | – | + | – | – | – | – | + | + | + | – | – | – | – | + | ? | – | – | |
| API 20 E : | ||||||||||||||||||||||
| A9 | E. Coli | + | – | + | + | – | – | – | + | – | + | + | + | + | + | + | + | + | – | – | + | |
| M9 | E. Coli | + | – | + | + | – | – | – | + | – | + | + | + | + | + | + | + | + | – | – | + | |
A12
M12
Photo 12 : Les caractères biochimiques de l’espèce Bacillus. cereus sur Galerie system Api E20 souches (A12) et (M12)
T12
Photo 13 : Caractères biochimiques de l’espèce Bacillus cereus sur galerie system Api E20 de la souche T12
A9
M9
Photo 14 : Caractères biochimiques de l’espèce Escherichia.Coli sur galerie system Api E20 de la souche A9 et M9
Parmi les 5 souches identifiées par system Api E20, les 2 souches A9 et M9 sont attribuées à l’espèce E. coli avec un degré de rapprochement de 100% et 3 souches à l’espèce Bacillus.cereus avec un degré de rapprochement de 85% pour le A12 et M12 alors que le degré de rapprochement atteint le 95 % pour la souche T12.
Pour l’identification et caractérisation des Pseudomonaceae :
Les souches (A3, M3, T3) appartenant à l’espèce type <em