Cette étude révèle comment l’antibiorésistance des entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre étendu impacte la santé publique à Sétif. Découvrez les gènes responsables de cette résistance et les implications cruciales pour le traitement des infections.
Support génétique mobile de la résistance
- Les plasmides
Les souches d’entérobactéries productrices de BLSE ont subit une extraction de leur contenu plasmidique par la méthode de (Kado et Liu. 1981).
L’analyse du contenu plasmidique des souches, après migration sur gel d’agarose (0.8%) a révélé que la majorité de souches hébergent un à quatre types de plasmides.
| Tableau 8 : Différents types de plasmides extraits des EBLSE | |||
|---|---|---|---|
| Nom de la souche | Code de la souche | Nombre de types de plasmide | Nombre d’isolats |
| Escherichia coli | Eco | 1 | N=19 (1.11.12.14.15.16.18.19.20.21 23.24.32.34.39.41.43.53.54) |
| Escherichia coli | Eco | 2 | N=1 (48) |
| Escherichia coli | Eco | 3 | N=2 (4.44) |
| Escherichia coli | Eco | 4 | N=1 (25) |
| Klebsiella pneumoniae | Kpn | 1 | N=12 (3.6.22.26.28.29.30 31.36.38.40.50) |
| Klebsiella pneumoniae | Kpn | 2 | N=6 (9.37.42.45.47.52) |
| Klebsiella pneumoniae | Kpn | 3 | N=3 (2.7.8) |
| Klebsiella pneumoniae | Kpn | 4 | N=1 (51) |
| Enterobacter cloacae | Ecl | 1 | N=3 (13.27.33) |
| Enterobacter cloacae | Ecl | 3 | N=1 (56) |
| Morganella morganii | Mmo | 1 | N=3 (17.46.55) |
| Serratia marcescens | Sma | 1 | N=2 (5.35) |
| Enterobacter aerogenes | Eae | 1 | N=1 (10) |
| Citrobacter freundii | Cfr | 1 | N=1 (49) |
( ) Numéros des isolats
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Figure 28. Profil plasmidique des 56 souches d’EBLSE.
Caractérisation des BLSE par la PCR-multiplex
La caractérisation des gènes de BLSE effectuée sur l’ADN (plasmidique ou chromosomique) de l’ensemble des souches par l’amplification multiple des gènes CTX-M, TEM et SHV a permis l’obtention de différents gènes de résistance amplifiés sur 33 souches.
BLSE de type CTX-M
Ce type de BLSE se reconnaît facilement sur l’antibiogramme en gélose car le CTX est habituellement la molécule la plus touchée avec une très bonne inhibition autour du disque contenant un inhibiteur de β-lactamases.
La caractérisation moléculaire de β-lactamases par PCR a révélé que 29/33des souches d’entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre étendue provenant des patients à titre externe et de patients hospitalisés aux différents services à l’hôpital, sont toutes porteuses d’un gène blaCTX-M (Fig.29), soit une prévalence de (87.88 %). Montré et Faire les espèces
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Figure 29. Amplifications par PCR-Multiplex des gènes blaCTX-M, blaSHV et blaTEM.
BLSE de type SHV
La BLSE de type SHV a été observée chez 15souches d’EBLSE soit une prévalence de (42.42 %) existant chez 12 souches K. pneumoniae, 2 d’E. coli et une souche d’E. aerogenes.
BLSE de type TEM
Les BLSE de type TEM sont peu fréquentes, elles ont été retrouvées chez 9 souches appartenant à K. pneumoniae (N=6), E. coli (n=2) et une seule souche E. aerogenes, soit une prévalence de (27.27 %).
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| Figure 30 : Prévalence des gènes de résistance chez les souches amplifiées | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| 100,00% | E. coli (14) | K. pneumoniae (14) | E. cloacae (2) | M. morganii (2) | E. aerogenes (1) |
| blaCTX-M | 68,75% | 44,83% | 100,00% | 100,00% | 33,33% |
| blaSHV | 12,50% | 37,93% | 33,33% | ||
| blaTEM | 18,75% | 17,24% | 33,33% | ||
Résistances multiples
- BLSE de type CTX-M/SHV
La BLSE de type CTX-M/SHV est observée chez 13 souches soit une prévalence de (39.39%), 11 K. pneumoniae, une E. aerogenes et une E. coli.
- BLSE de type CTX-M/TEM
Ce type de BLSE a été observé chez 6 souches soit (18.18%), 4 K. pneumoniae, 1 E. aerogenes et 1 E. coli.
- BLSE de type CTX-M/SHV/TEM
La BLSE de type CTX-M/SHV/TEM est observée chez 5 souches soit une prévalence de (15.15 %), 4 K. pneumoniae et une seule souche E. aerogenes.
| Tableau 9 : Caractéristiques générales et moléculaires des souches d’entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre étendu isolées au CHU de Sétif | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Souches | Code | Services | prélèvement | Sexe | Gène BLSE |
| Kpn | 1(72c) | Orth | Pus | F | blaCTX-M |
| Kpn | 2(62c) | Hto | Sang | F | blaCTX-M |
| Kpn | 3(72s) | Orth | Pus | F | blaSHV |
| Kpn | 4(62s) | Hto | Sang | F | blaSHV |
| Kpn | 5(72t) | Ortho | Pus | F | blaTEM |
| Kpn | 6(62t) | Hto | Sang | F | blaTEM |
| Kpn | 7 | Ext | Urine | M | blaTEM |
| Kpn | 10 | BUC | LCR | M | blaCTX-M blaSHV |
| Kpn | 11 | N-Ch | Trachéal | M | blaCTX-M blaSHV blaTEM |
| Kpn | 18 | Ext | Pus | M | blaCTX-M blaSHV |
| Kpn | 19 | Cx | Urine | M | blaCTX-M blaSHV |
| Kpn | 20 | Ext | Urine | M | blaCTX-M blaSHV |
| Kpn | 22 | Orth | Pus | F | blaCTX-M blaSHV |
| Kpn | 23 | Ext | Pus | F | blaCTX-M blaSHV |
| Kpn | 24 | N-nat | LCR | F | blaCTX-M |
| Kpn | 31 | Néph | Sonde Uri | M | blaCTX-M blaSHV blaTEM |
| Kpn | 32 | Péd | LCR | M | blaCTX-M blaSHV |
| Kpn | 36 | Péd | Urine | M | blaCTX-M |
| Kpn | 38 | Ortho | Pus | F | blaCTX-M blaSHV blaTEM |
| Kpn | 39 | Hto | Sang | F | blaCTX-M blaSHV blaTEM |
| Eco | 9 | CHF | Pus | F | blaTEM |
| Eco | 13 | Cx | Pus | M | blaCTX-M |
| Eco | 14 | BUM | Pus | F | blaCTX-M |
| Eco | 15 | Ext | Urine | F | blaCTX-M |
| Eco | 16 | Péd | Urine | F | blaSHV |
| Eco | 17 | Cx | Urine | M | blaCTX-M blaSHV |
| Eco | 21 | Ext | Urine | F | blaCTX-M blaTEM |
| Eco | 25 | Cx | Pus | M | blaCTX-M |
| Eco | 26 | Péd | LCR | M | blaCTX-M |
| Eco | 29 | Cx | Urine | M | blaCTX-M |
| Eco | 30 | BUC | Pus | M | blaCTX-M |
| Eco | 33 | Cx | Urine | F | blaTEM |
| Eco | 35 | Cx | Urine | F | blaCTX-M |
| Eco | 37 | Ext | Urine | F | blaCTX-M |
| Eae | 12 | Cardio | Pus | M | blaCTX-M blaSHV blaTEM |
| Ecl | 8 | Ext | Urine | F | blaCTX-M |
| Ecl | 27 | Néph | Urine | F | blaCTX-M |
| Mmo | 28 | MI | Pus | M | blaCTX-M |
| Mmo | 34 | MI | Pus | M | blaCTX-M |